而這時(shí)葉向高終于到了京師，進(jìn)了內(nèi)閣，當(dāng)然，和歷史稍有不同的是，首輔還是方從哲，葉向高為次輔，再加上劉一燝和韓爌兩位閣員，內(nèi)閣一共是四個(gè)人。葉向高是王化貞的座師，當(dāng)然支持他，而這時(shí)的兵部尚書張鶴鳴和熊廷弼關(guān)系很不好（當(dāng)然，朝中和熊廷弼關(guān)系好的很少，包括楚黨中人，因?yàn)樾芡㈠鲎彀吞?，得罪人太多），因?yàn)樾芡㈠鲈?jīng)罵過他和葉向高不懂軍事，是兩個(gè)大草包。他很欣賞王化貞，在他的縱容之下，朝中已經(jīng)有人放出風(fēng)聲，認(rèn)為應(yīng)該讓熊廷弼下臺(tái)，讓王化貞去當(dāng)經(jīng)略，總領(lǐng)遼東事務(wù)。
　　朱由校覺得現(xiàn)在這樣經(jīng)撫不和，顯然是不利于遼東事宜的，于是在熊廷弼出關(guān)來到右屯時(shí)，嘗試提出由熊廷弼節(jié)制王化貞，一起守好廣寧。
　　這下葉向高不干了，他支持王化貞不受熊的節(jié)制，并向皇帝上疏，稱：“欲化貞受其節(jié)制，則舉朝之人皆以為難行?！?br/>　　不久王化貞上奏，認(rèn)為如果朝廷給他專事遼東之權(quán)，他只需要六萬兵，就可在明年三月蕩平遼東，熊廷弼則認(rèn)為他是說大話，兩人開始用奏折吵架。
　　京營的捷報(bào)，使得京師成了歡樂的海洋。前不久毛文龍的捷報(bào)已經(jīng)讓京師人興奮了一回，毛文龍不過斬首幾百，而這次則是斬首一千四百多，真夷都有六百多喲。而群臣也是交相祝賀，都覺得有王化貞在，遼東形勢一片大好，建奴即將被一舉蕩平。
　　所以當(dāng)年輕的皇帝再次提出要用熊廷弼節(jié)制王化貞時(shí)，大臣們的反應(yīng)是憤怒。明明是王化貞立了這么大的功，熊廷弼躲在后面玩他的以守代攻，現(xiàn)在竟然要王化貞受熊大嘴的節(jié)制，有沒有搞錯(cuò)呀。首先在葉向高的示意下，左光斗出列反對，認(rèn)為王化貞的一舉蕩平符合實(shí)際，現(xiàn)在毛文龍和京營的捷報(bào)就是例證，而熊廷弼的守而后戰(zhàn)只是徒耗國帑，難見成效，且其置遼東漢民于何地。
　　然后群臣紛紛上奏，大都是支持王化貞而反對熊廷弼的，包括葉向高，劉一燝，韓爌等內(nèi)閣中人和兵部尚書張鶴鳴都是支持王化貞的，他們都是東林黨人。方從哲則是支持熊廷弼的，而且他認(rèn)為須在經(jīng)略和巡撫中選定一人，專任遼事，事權(quán)合一方能取得成效。
　　朱由校見形勢不妙，只得將這個(gè)提議做罷，群臣見皇帝終于低頭，不再堅(jiān)持自己錯(cuò)誤的意見，都大感欣慰，覺得這小皇帝雖然眼光不行，但至少在接受意見方面比他爺爺要強(qiáng)得多。
　　皇帝將方從哲等內(nèi)閣中人及兵部尚書留了下來，一起來到西曖閣。大家坐下后，朱由校將近衛(wèi)軍眾將的奏折發(fā)給大家傳看，看完后，大家都陷入了沉默。
　　“各位愛卿看了后覺得如何，朕想聽聽真心話?！敝煊尚咭暳舜蠹乙谎?，“本兵，這是你的職責(zé)，你先說吧?！?br/>　　張鶴鳴嘴唇動(dòng)了兩下，卻沒有說出話來，他輕輕地咳嗽了一下，然后道：“楊同知所言，只是其一家之言，且楊同知年歲尚輕，識(shí)人之術(shù)未必就可為真?！边@話就有點(diǎn)強(qiáng)詞奪理了，皇帝先就說了是近衛(wèi)軍三將合寫的奏折，周遇吉和曹文詔可已經(jīng)是成年人了。朱由校沒有理他，看向葉向高。